|   IChO   |

 

IChO PAN

 

Historia Instytutu
  Instytut obecnie
  Rada Naukowa Instytutu
  Struktura Instytutu
  Studia doktoranckie

Informacje ogólne

Wymagania dla kandydatów i procedura kwalifikacyjna

Program studiów

Zadania z egzaminów wstępnych z lat 1990 - 2006

Regulamin Studium Doktoranckiego

Plan wykładów
w bieżącym semestrze

Materiały do wykładów na studium doktoranckim

  Konferencje i szkoły
  Wykłady i seminaria
  Obrony prac doktorskich
  Usługi analityczne
   CEDNETS
   Książka telefoniczna
   Przetargi

 

STUDIA DOKTORANCKIE

Widma do wykładu "Zaawansowane metody identyfikacji związków organicznych" oraz samodzielnych ćwiczeń z tej dziedziny


Podziękowania

Widma NMR zamieszczone na tej stronie zostały wykonane w Zespole XV IChO PAN. Wszystkim pracownikom tego zespołu składam serdeczne podziękowanie - bez ich pracy przygotowanie tego wykładu byłoby niemożliwe.

Witold Danikiewicz


ZADANIA

 

Skróty stosowane do opisu widm NMR:

  1H – standardowe widmo protonowe

  13C – standardowe widmo węglowe z pełnym rozprzęganiem

  13C DEPT – widmo węglowe typu DEPT (135° o ile nie podano innej wartości)

  13C Gated Decoupling – widmo węglowe z zachowanymi stałymi sprzężenia 1H–13C

  COSY – widmo korelacyjne (2D) 1H–1H

  HSQC lub HETCOR (dla Variana) – widmo korelacyjne (2D) 1H–13C przez 1 wiązanie

  HMBC – widmo korelacyjne (2D) 1H–13C przez 2-3 wiązania

  NOE – widmo do prostego eksperymentu NOE

  NOE ref. – widmo referencyjne NOE (do odjęcia od pozostałych widm NOE)

  NOESY – widmo korelacyjne (2D) typu NOE – pokazuje protony oddziałujące na siebie przez przestrzeń

Widma ze spektrometru Bruker 500 MHz 

Podana nazwa związku jest najczęściej także jest nazwą folderu z danymi (w niektórych przypadkach ze względów na ograniczenia systemowe nazwa folderu jest nieznacznie zmieniona lub skrócona). Wymienione dalej numery są numerami eksperymentów – nie muszą to być kolejne liczby. Skróty przy numerach określają rodzaj widma w danym folderze. Jeśli po nazwie związku nie podano rozpuszczalnika, oznacza to, że widma były rejestrowane w CDCl3.

1-heptyn

wydruki      FID-y

1. 1H
2. COSY
3. HSQC
4. HMBC
5. DEPT
6. 13C

aldehyd krotonowy

wydruki      FID-y

1. 1H
2. HSQC
3. 13C

etylooksiran

wydruki      FID-y

1. 1H
2. HSQC
3. 13C

o-chloronitrobenzen

wydruki      FID-y

1. 1H
2. HSQC
3. 13C

m-chloronitrobenzen

wydruki       FID-y

1. 1H
2. HSQC
3. 13C

p-chloronitrobenzen

wydruki       FID-y

1. 1H
2. HSQC
3. 13C

chinolina

wydruki       FID-y

1. 1H

2. 1H (większe stężenie)
3. COSY
4. HSQC
5. DEPT
6. 13C

Uwaga: zawiera zanieczyszczenia

chinolina-HMBC

wydruki - patrz chinolina       FID-y

1. 1H

2. HMBC
3. 13C

Uwaga: uzupełnienie do zestawu "chinolina"

6-nitrochinolina

wydruki       FID-y

1. 1H

2. COSY
3. HSQC
4. DEPT

5. 13C

11. 1H (powtórzone - mniejsze stężenie)

1-nitronaftalen

wydruki       FID-y

1. 1H

2. 1H (większe stężenie)
3. COSY
4. HSQC
5. DEPT
6. 13C

1-nitronaftalen-HMBC

wydruki - patrz 1-nitronaftalen       FID-y

1. 1H

2. HMBC
3. 13C

Uwaga: uzupełnienie do zestawu "1-nitronaftalen"

2,4-dinitro-1-naftol

wydruki       FID-y

1. 1H

2. COSY
3. HSQC
4. 13C

5. 13C Gated Decoupling

6. HMBC

11. 1H (powtórzone)

12. 13C (powtórzone, znacznie lepsze)

NEt3

wydruki       FID-y

1. 1H
2. 13C

(widma w D2O)

NEt4I

wydruki       FID-y

1. 1H
2. 13C

(widma w D2O)

mentol

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY
3. HSQC
4. HMBC
5. DEPT
6. 13C

11. 1H (powtórzone)

kamfora

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. NOESY
4. HSQC
5. HMBC
6. DEPT
7. 13C

katechina-DMSO

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY
3. HSQC
4. HMBC
5. DEPT
6. 13C

7. 1H (powtórzone - mniejsze stężenie)

(widmo w DMSO-d6)

katechina-metanol

wydruki       FID-y

1. 1H
(widmo w CD3OD)

W251-I*

wydruki       FID-y

1. 1H
2. DEPT
3. 13C
4. COSY
5. HSQC
6. HMBC

W251-II*

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY
3. HSQC
4. HMBC
5. DEPT
6. 13C

DKX130**

wydruki       FID-y

1. 1H
2. HMBC
3. 13C

maleinian dimetylu

wydruki      FID-y

1. 1H

2. 13C

3. 13C Gated Decoupling

fumaran dimetylu

wydruki      FID-y

1. 1H

2. 13C

3. 13C Gated Decoupling

1-Br-2,2-dietoksyetan

wydruki      FID-y

1. 1H

pentaoctan a-D-glukozy

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. HSQC
4. HMBC
5. DEPT
6. 13C

pentaoctan b-D-glukozy

wydruki       FID-y

1. 1H
2. DEPT

3. 13C
4. COSY
5. HSQC
6. HMBC

geraniol

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. HSQC
4. HMBC
5. DEPT
6. 13C

12. - 16. NOE

17. - NOE ref.

nerol

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. HSQC
4. HMBC
5. 13C

nerol-NOE

wydruki       FID-y

2. - 5. NOE

6. - NOE ref.

DKB52**

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. HSQC
4. HMBC
5. 13C

12. - 16. NOE

17. - NOE ref.

a-pinen

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. NOESY
4. HSQC
5. HMBC
6. DEPT
7. 13C

borneol i izoborneol

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. NOESY
4. HMBC
5. HSQC
6. DEPT
7. 13C

 

o-fluoronitrobenzen

wydruki      FID-y

1. 1H
2. HSQC
3. 13C

m-fluoronitrobenzen

wydruki       FID-y

1. 1H
2. HSQC
3. 13C

p-fluoronitrobenzen

wydruki       FID-y

1. 1H
2. HSQC
3. 13C

WDP1***

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. HSQC
4. HMBC
5. DEPT
6. 13C

7. 31P

WDP2***

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. HSQC
4. HMBC
5. DEPT
6. 13C

7. 31P

W391***

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. HSQC
4. HMBC
5. DEPT
6. 13C

13. 31P

Me4NI

wydruki       FID-y

2. 13C

12. 1H
(widma w D2O)

Pr4NBr

wydruki      FID-y

1. 1H
2. HSQC
3. 13C

(widma w D2O)

Bu4NI

wydruki      FID-y

1. 1H
2. 13C
3. HSQC

(widma w D2O)

1-MOM-6-NO2-indol

wydruki       FID-y

1. 1H
2. DEPT

3. 13C
4. HSQC
5. HMBC

1-pMeOBn-6-NO2-indol

wydruki       FID-y

1. 1H
2. DEPT

3. 13C
4. HSQC
5. HMBC

1-MOM-6-NO2-7-tBuSO2CH2-indol

wydruki       FID-y

1. 1H w DMSO t. pok.
2. 1H w DMSO 77 ºC

11. 1H w CDCl3
12. HSQC w CDCl3
13. HMBC w CDCl3

14. 13C w CDCl3

1-pMeOBn-6-NO2-7-tBuSO2CH2-indol w CDCl3

wydruki       FID-y

1. 1H
11. 1H (powt.)

12. HSQC
13. HMBC
14. 13C

1-pMeOBn-6-NO2-7-tBuSO2CH2-indol w DMSO

¬ obok      FID-y

1. 1H w t. pok.
2. 1H w 77 ºC

11. 1H w t. pok. (powt.)
12. 13C
13. HSQC

14. HMBC

wodorosiarczan clopidogrelu w D2O

wydruki       FID-y

1. 1H
2. DEPT

3. 13C
4. COSY
5. HSQC
6. HMBC

wodorosiarczan clopidogrelu w DMSO

wydruki       FID-y

1. 1H w t. pok.
11. 1H w 100 ºC

12. 13C w 100 ºC
13. COSY w 100 ºC
14. HSQC w 100 ºC
15. HMBC w 100 ºC

klawam RRR***

wydruki       FID-y

1. 1H
11. 1H (powt.)
12. - 14. NOE

15. NOE ref.

klawam RSR***

wydruki       FID-y

1. 1H

klawam RSS***

wydruki       FID-y

1. 1H
2. - 5. NOE

6. NOE ref.

klawam SRR***

wydruki       FID-y

1. 1H

klawam SRS***

wydruki       FID-y

1. 1H

2. 13C
11. 1H (powt.)

12. - 16. NOE

17. NOE ref.

faropenem***

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. HSQC
4. HMBC
5. 13C

(widma w DMSO-d6)

Grela-nitrowy***

wydruki       FID-y

1. 1H
2. 13C

Grela-chinolinowy***

wydruki       FID-y

1. 1H
2. DEPT

3. 13C

(widma w CD2Cl2)

porfiryna MG318***

wydruki       FID-y

1. 1H
2. 13C

brucyna

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. NOESY
4. HSQC
5. HMBC
6. 13C
7. DEPT 45º

8. DEPT 90º

9. DEPT 135º

paclitaxel (Taxol)

wydruki       FID-y

1. 1H
2. COSY

3. HSQC
4. HMBC
5. DEPT
6. 13C

(widma w DMSO-d6)

* Informacja na temat tych związków znajduje się w materiałach do Wykładu 9-10

** Informacja na temat tych związków znajduje się w materiałach do Wykładu 11-12

*** Informacja na temat tych związków znajduje się w materiałach do Wykładu 13-14

 

 

Widma ze spektrometru Varian 400 MHz 

Podana nazwa jest nazwą związku. Wymienione dalej nazwy są nazwami folderów poszczególnych eksperymentów. Skróty określają rodzaj widma w danym folderze. Jeśli po nazwie związku nie podano rozpuszczalnika, oznacza to, że widma były rejestrowane w CDCl3.

akrylan metylu

wydruki      FID-y

meakr.fid  -  1H
meakrc.fid  -  13C
meakrd.fid  -  DEPT

octan winylu

wydruki      FID-y

vac.fid  -  1H
vacc.fid  -  13C
vacd.fid  -  DEPT

gliceryna

wydruki      FID-y

gliceryna.fid - 1H w DMSO
glicerynad2o.fid - 1H w D2O

Z-1,4-dichlorobut-2-en

wydruki      FID-y

Z-dcb.fid - 1H
Z-dcbc.fid - 13C Gated Decoupling

E-1,4-dichlorobut-2-en

wydruki      FID-y

E-dcb.fid - 1H
E-dcbc.fid - 13C Gated Decoupling

Z-heks-2-en

wydruki      FID-y

Z-2hex.fid - 1H
Z-2hexc.fid - 13C

Z-2hexd.fid - DEPT

E-heks-2-en

wydruki      FID-y

E-2hex.fid - 1H
E-2hexc.fid - 13C

E-2hexd.fid - DEPT

chlorowodorek estru metylowego fenyloalaniny

wydruki      FID-y

phemehcl.fid - 1H w DMSO
phemehcld2o.fid - 1H w D2O

glicylo-tyrozyna

wydruki      FID-y

glytyr.fid  -  1H w DMSO

aspartam

wydruki      FID-y

aspartam.fid - 1H w DMSO
aspartamd2o.fid - 1H w D2O

pentaoctany a- i b-galaktozy (mieszanina)

wydruki      FID-y

galac5.fid - 1H w CDCl3
galac5h.fid - 1H w C6D6

 

cyklobenzaprina

wydruki      FID-y

cbp.fid - 1H
cbpc.fid - 13C

cbpd.fid - DEPT

cbphc.fid - HETCOR

(widma w DMSO-d6)

chlorowodorek cyklobenzapriny

wydruki      FID-y

cbpcl.fid - 1H
cbpclc.fid - 13C

cbpcld.fid - DEPT

cbpclhc.fid - HETCOR

(widma w DMSO-d6)

N-tlenek cyklobenzapriny

wydruki      FID-y

cbpo.fid - 1H
cbpoc.fid - 13C

cbpod.fid - DEPT

cbpoh.fid - 1H - duże stęż.

cbpohc.fid - HETCOR

(widma w DMSO-d6)

     

Zadania

Widma do poniższych zadań znajdują się w tabelach powyżej lub odsyłacze do widm są podane w treści zadania.

Zadania do wykładu 9-10

Zadanie 1.

Przeprowadzić pełną interpretację widm 1H i 13C NMR aldehydu krotonowego (przypisania sygnałów, wyznaczenie przesunięć chemicznych i stałych sprzężenia).

Zadanie 2.     Wydruki widm do Zadania 2

Na podstawie zestawu widm MS, IR i NMR zidentyfikować związek N1 i dokonać pełnej interpretacji widm 1H i 13C NMR (przypisania sygnałów, wyznaczenie przesunięć chemicznych i stałych sprzężenia).

Zadanie 3.

Przeprowadzić pełną interpretację widm 1H i 13C NMR (przypisania sygnałów, wyznaczenie przesunięć chemicznych i stałych sprzężenia) chinoliny i 6-nitrochinoliny.

Zadanie 4.     Wydruki widm do Zadania 4:  NCh-N1  i  NCh-N2

Na podstawie zestawu widm NMR ustalić położenie grupy nitrowej w nitrochinolinach NCh-N1 i NCh-N2 oraz dokonać pełnej interpretacji widm 1H i 13C NMR (przypisania sygnałów, wyznaczenie przesunięć chemicznych i stałych sprzężenia).

Zadanie 5.     Wydruki widm do Zadania 5:   K1 K2  i  K3

Ustalić budowę trzech izomerycznych kwasów chloronitrobenzoesowych K1K3 na podstawie ich widm 1H, 13C, HSQC i HMBC.

Zadania do wykładu 11-12

Zadanie 1.

Przeprowadzić interpretację widm 1H NMR aspartamu (popularny zamiennik cukru) w DMSO-d6 i D2O. W szczególności przypisać dwa dające się wyodrębić w widmach układy ABX odpowiednim grupom protonów w cząsteczce.

Zadanie 2.

Przeprowadzić możliwie pełną interpretację widm 1H i 13C NMR pentaoctanów a- i b-D-glukozy. Zadanie minimum: wyznaczyć wartości stałych sprzężenia między atomami wodoru w pierścieniu.

Zadanie 3.

Na podstawie widm 1H NMR mieszaniny pentaoctanów a- i b-D-galaktozy, zarejestrowanych w CDCl3 i  w C6D6, ustalić zawartości obu anomerów w tej mieszaninie. Przeanalizować podobieństwa i różnice pomiędzy widmami w tych rozpuszczalnikach. Który z nich jest lepszy w przypadku tej próbki?

Zadanie 4.

Przeprowadzić możliwie pełną interpretację widm NMR kamfory (przypisania sygnałów, wyznaczenie przesunięć chemicznych i stałych sprzężenia tam, gdzie to możliwe).

Zadanie 5.

Przeprowadzić możliwie pełną interpretację widm NMR a-pinenu (przypisania sygnałów, wyznaczenie przesunięć chemicznych i stałych sprzężenia tam, gdzie to możliwe).

Zadanie 6.

W wyniku redukcji kamfory mogą powstać dwa alkohole: borneol i izoborneol. Na podstawie kompletu widm NMR zaproponować konfigurację grupy OH w badanym związku (jego widma są zatytułowane ‘borneol’, ale nie należy się tym sugerować) lub wykazać, że na podstawie tych widm jednoznaczne określenie konfiguracji nie jest możliwe.

Zadanie 7.

1. Przeprowadzić interpretację widm 1H, 13C i HMBC kwasu 5-okso-cykloheks-3-enokarboksylowego (nazwa widm w tabeli powyżej: DKX130). Wzór kwasu podany jest w materiałach do Wykładu 11-12.
2. Wykorzystując modelowanie molekularne (np. programem PCModel) zaproponować najtrwalszą konformację cząsteczki tego związku.
3. Wykazać, że obliczona konformacja jest zgodna z danymi doświadczalnymi (przez porównanie zmierzonych i obliczonych stałych sprzężenia 3JH-H).
 

Zadania do wykładu 13-14

Zadanie 1.       Wydruki widm do Zadania 1: KFNB1 i KFNB2

Przeprowadzić analizę widm NMR dwóch izomerycznych kwasów fluoronitrobenzoesowych KFNB1 i KFNB2 i ustalić na tej podstawie ich budowę.

Zadanie 2.       Wydruki widm do Zadania 2: KdiFNB

1. Wykorzystując wiedzę zdobytą podczas rozwiązywania Zadania 1 ustalić budowę cząsteczki kwasu difluoronitrobenzoesowego (symbol: KdiFNB) na podstawie jego widm NMR.
2. Przypisać sygnały w widmie 19F odpowiednim atomom fluoru w cząsteczce (wskazówka: wykorzystać linie satelitarne 13C w widmie fluorowym).
3. Wyznaczyć stałą sprzężenia fluor – fluor.

Wskazówka: warto zacząć od widma fluorowego. Typowe stałe sprzężenia F-F w pierścieniu benzenowym wynoszą: orto - 18-35 Hz, meta - 0-15 Hz, para - 4-16 Hz. Stałe sprzężenia H-F podano na wykładzie 13-14.


Zadanie 3.

1. Przeprowadzić możliwie pełną interpretację widm 1H, 13C, DEPT, HSQC i HMBC P-tlenku 1-fenylo-2,3-dihydrofosfol-3-olu (wzór jest podany w materiałach do wykładu 13-14; nazwa widm w tabeli powyżej: WDP2).
2. Wyznaczyć, tam gdzie to możliwe, stałe sprzężenia H-P i C-P.
3. Określić, jaki wpływ wywiera podstawnik P(O)R1R2 na przesunięcia chemiczne atomów węgla wiązania podwójnego C=C.
Uwaga: badano pojedynczy izomer (cis lub trans), ale nie wiadomo który.

Zadanie 4.

Przeprowadzić analizę widm 1H i 13C NMR jodku tetra-n-butyloamoniowego w wodzie. Stwierdzić, czy widma te stosują się do reguł ustalonych na podstawie analizy widm soli o krótszych łańcuchach węglowych.

Zadanie 5.

Przeprowadzić interpretację widm NMR opisanych w wykładzie 13-14 pochodnych indoli:

  • 1-metoksymetylo-6-nitroindol

  • 1-p-metoksybenzylo-6-nitroindol

  • 1-metoksymetylo-6-nitro-7-(t-butylosulfonylometylo)-indol

  • 1-p-metoksybenzylo-6-nitro-7-(t-butylosulfonylometylo)-indol

Zadanie 6.

1. Przeprowadzić interpretację widm NMR wodorosiarczanu clopidogrelu w D2O w temperaturze pokojowej i w DMSO-d6 w temperaturze 100 ºC. Porównać uzyskane wyniki.
2. Ocenić na podstawie przeprowadzonej interpretacji na ile pomocne są widma 2D podczas analizy widm substancji dających szerokie i bardzo szerokie sygnały (zwłaszcza w widmach protonowych).

Zadanie 7.

W wyniku syntezy antybiotyku b-laktamowego - faropenemu - otrzymano jeden z dwóch możliwych izomerów różniących się konfiguracją na atomie węgla 6. Ustalić na podstawie analizy widm NMR, czy otrzymano produkt cis czy trans. Uwaga: (wzór faropenemu jest podany w materiałach do wykładu 13-14.

Zadanie 8.

Dokończyć interpretację widm 1H i 13C NMR przedstawionego na wykładzie 13-14 tzw. nitrowego katalizatora metatezy (nazwa widm w tabeli powyżej: Grela-nitrowy).

Zadanie 9.

Przeprowadzić interpretację widm 1H i 13C NMR tzw. chinolinowego katalizatora metatezy (nazwa widm w tabeli powyżej: Grela-chinolinowy). Zwrócić uwagę na wspólne cechy widm NMR katalizatorów tego typu.

Zadanie 10.

Przeprowadzić interpretację widm NMR brucyny.

Zadanie 11.

Przeprowadzić interpretację widm NMR paclitaxelu (Taxolu).